"Двунаправленная связь" значит, что не только просматриваемый товар ссылается на связанный, но и связанный ссылается на него. При включенной настройке "Двунаправленная связь", удаление ссылки с одного из товаров не приведет к удалению ссылки в противоположном направлении. Для полного удаления связи между товарами, вначале отключите настройку "Двунаправленная связь", затем удалите ссылку на связанный товар.